De isomeraser De är en klass av enzymer som är involverade i strukturell eller positionell omläggning av isomerer och stereoisomerer av olika molekyler. De finns i praktiskt taget alla cellulära organismer som uppfyller funktioner i olika sammanhang.
Enzymer av denna klass verkar på ett enda substrat, även om vissa kan vara kovalent associerade med kofaktorer, joner, bland andra. Den allmänna reaktionen kan därför ses som följer:
X-Y → Y-X
Reaktionerna katalyserade av dessa enzymer involverar en intern omläggning av bindningarna, vilket kan betyda förändringar i positionen för funktionella grupper, i positionen för dubbelbindningar mellan kol, bland annat, utan förändringar i substratets molekylformel..
Isomeraser fyller olika funktioner i en mängd olika biologiska processer, inklusive metaboliska vägar, celldelning, DNA-replikering, för att nämna några..
Isomeraser var de första enzymerna som användes industriellt för produktion av sirap och andra sockerhaltiga livsmedel, tack vare deras förmåga att omvandla isomerer av olika typer av kolhydrater..
Artikelindex
Isomeraser deltar i flera viktiga cellulära processer. Bland de mest framträdande är DNA-replikering och förpackning, katalyserad av topoisomeraser. Dessa händelser är avgörande för replikering av nukleinsyra, liksom för dess kondensation före celldelning..
Glykolys, en av de centrala metaboliska vägarna i cellen, innefattar minst tre isomera enzymer, nämligen: fosfoglukos-isomeras, triofosfatisomeras och fosfoglyceratmutas..
Omvandlingen av UDP-galaktos till UDP-glukos i galaktos-katabolismvägen åstadkommes genom verkan av ett epimeras. Hos människor är detta enzym känt som UDP-glukos 4-epimeras..
Proteinvikning är en viktig process för funktionen hos många enzymer i naturen. Proteindisulfidisomerasenzymet hjälper till att fälla proteiner som innehåller disulfidbryggor genom att ändra deras position i de molekyler som det använder som substrat..
Huvudfunktionen hos enzymer som tillhör klassen av isomeraser kan ses som att transformera ett substrat genom en liten strukturförändring, för att göra det mottagligt för ytterligare bearbetning av enzymer nedströms i en metabolisk väg, till exempel.
Ett exempel på isomerisering är förändringen från fosfatgruppen i position 3 till kolet i position 2 i 3-fosfoglyceratet för att omvandla det till 2-fosfoglycerat, katalyserat av enzymet fosfoglyceratmutas i den glykolytiska vägen, vilket genererar en högre energiförening vad är ett funktionellt substrat för enolas.
Klassificeringen av isomeraser följer de allmänna reglerna för klassificering av enzymer som föreslagits av Enzymkommissionen (Enzymkommission) 1961, där varje enzym får en numerisk kod för sin klassificering.
Placeringen av siffrorna i nämnda kod indikerar var och en av indelningarna eller kategorierna i klassificeringen och dessa siffror föregås av bokstäverna "EC".
För isomeraser representerar den första siffran den enzymatiska klassen, den andra betecknar typen av isomerisering de utför och den tredje substratet som de verkar på..
Nomenklaturen för isomerasklass är EC.5. Den har sju underklasser, så enzymer med koden från EC.5.1 till EC.5.6 kommer att hittas. Det finns en sjätte "underklass" av isomeraser kända som "andra isomeraser", vars kod är EC.5.99, eftersom den innehåller enzymer med olika isomerasfunktioner..
Beteckningen av underklasserna görs huvudsakligen enligt den typ av isomerisering som dessa enzymer utför. Trots detta kan de också få namn som racemaser, epimerases, cis-trans-isomeraser, isomeraser, tautomeraser, mutaser eller cyklo-isomeraser.
Det finns 7 klasser av enzymer inom isomerasfamiljen:
De katalyserar bildandet av racemiska blandningar baserat på positionen för a-kolet. De kan verka på aminosyror och derivat (EC.5.1.1), på hydroxisyragrupper och derivat (EC.5.1.2), på kolhydrater och derivat (EC.5.1.3) och andra (EC.5.1.99).
Katalysera omvandlingen mellan isomera former cis Y trans av olika molekyler.
Dessa enzymer är ansvariga för isomerisering av inre delar i samma molekyl. Det finns några som utför redoxreaktioner, där elektrondonator och acceptor är samma molekyl, så de klassificeras inte som oxidoreduktaser.
De kan agera genom att omvandla aldoser och ketoser (EC.5.3.1), på keto- och enolgrupper (EC.5.3.2), ändra positionen för CC-dubbelbindningar (EC.5.3.3), för SS-disulfidbindningar (EC.5.3.4) och andra ”oxidoreduktaser” (EC.5.3.99).
Dessa enzymer katalyserar lägesförändringarna för olika grupper inom samma molekyl. De klassificeras efter typen av grupp de "flyttar".
Det finns fosfomutaserna (EC.5.4.1), de som överför aminogrupper (EC.5.4.2), de som överför hydroxylgrupper (EC.5.4.3) och de som överför andra typer av grupper (EC.5.4 99).
De katalyserar "eliminering" av en grupp som ingår i en molekyl, men som fortfarande är kovalent bunden till den.
De kan verka genom att ändra konformationen av polypeptider (EC.5.6.1) eller nukleinsyror (EC.5.6.2).
Denna underklass sammanför enzymer såsom tiocyanatisomeras och 2-hydroxikrom-2-karboxylatisomeras..
Ingen har kommenterat den här artikeln än.